La Direction de la Recherche et de l'Innovation (DRI) a pour mission de mettre en œuvre le programme du Ministère concernant la Recherche et l'innovation, conformément au décret n°2022-510 du 13 avril 2022. Elle contribue à la coordination et à la mise en œuvre des politiques de Recherche et d'Innovation, ainsi qu'à la conception des documents de gestion et d'orientation dans ce domaine. La DRI appuie également la mise en œuvre des activités de valorisation de la Recherche, notamment par l'organisation de manifestations scientifiques et le renforcement des capacités des chercheurs. Elle vise à établir un écosystème propice à la création et à la valorisation de la Recherche par le biais de la Maison d’Incubation de la Recherche, en facilitant les échanges entre producteurs et utilisateurs de connaissances. Enfin, elle doit prendre en compte les exigences du marché pour assurer la compétitivité et l'efficacité de la Recherche à Madagascar pour le développement du pays.